Ich vermute, dass das schlicht der Zahn der Zeit ist.
Wenn wir ehrlich sind, gab es früher auch viele Anime die sich ähnlich sahen - "Alice im Wunderland", "Sara, die kleine Prinzessin", "Anne mit den roten Haaren", etc. - diese weisen fast alle die selben Merkmale der Charaktere auf (Form der Augen, wie die Haare dargestellt werden usw.). Irgendwann änderte sich vermutlich einfach der Geschmack - großäugige Shoujo-Anime wurden vermehrt produziert um Hypes wie "Sailor Moon" und "Jeanne, die Kamikazediebin" nachzueifern.
Ein zweiter Punkt ist vermutlich auch die Masse an Vorlagen (und auch eigenen Ideen von Studios) - die Zeichenstile einiger Mangaka gleichen sich wie ein Ei dem anderen, also lässt sich das auch in der Anime-Umsetzung kaum vermeiden, denn der persönliche Stil des Erfinders sollte IMO immer noch zu erkennen sein.
Sind aber jetzt nur meine persönlichen Vermutungen zu dem Thema :)