Was die Geld-Thematik angeht: da bin ich mir nicht mal so sicher, ob das der einzige Grund ist. Hideaki Anno ist bekannt dafür, dass er gerne mit Szenen spielt und ich glaube mich zu erinnern, erst letztens gelesen zu haben, dass es durchaus auch Stilmittel von ihm war; aber ich finde den Artikel dazu leider nicht mehr 
Was Shinji und seine Rolle in der Serie angeht, gebe ich Dir vollkommen recht - als Teenie habe ich ihn regelrecht gehasst, inzwischen kann ich ihn durchaus an manchen Stellen sehr sehr gut verstehen, aber dass er der Mittelpunkt der Serie ist, stört mich auch immer wieder etwas; so gehen die Probleme von Misato oder Ritsuko teilweise etwas unter. Und auch was Kaworu betrifft, kann ich Dir nur zustimmen; das hätte besser gelöst werden sollen :/
Zu den Charakteren möchte ich noch kurz sagen, dass man jeden von ihnen einzeln betrachten muss. Asuka ist durchaus nervig, aber wenn man ihre Vergangenheit betrachtet, dann ist einiges sehr gut nachvollziehbar. Rei hat es da etwas schwieriger, aber auch ihre Gedanken wurden gut dargestellt.
Im Prinzip ist NGE eine Ansammlung an gebrochenen Charakteren, die alle ihre Probleme irgendwie zu bewältigen versuchen und nebenbei noch die Welt retten sollen (nun ja, offiziell zumindest). Es wäre eine sehr deprimierende Serie geworden, hätte man sich nur auf das Dilemma der Personen beschränkt; aber so geht vieles auch neben der ganzen Action unter. Ich bin da manchmal etwas zwiegespalten, aber im Prinzip kann ich inzwischen - nach seeeehr vielen Re-watches der Serie - die meisten Personen und ihre Ansichten verstehen; das fiel mit mit 16 deutlich schwerer und die Action stand für mich im Vordergrund 
Was diese anderen Realitäten angeht: schau Dir den Film "End of Evangelion" an, da kommt das alles :)
Viele Fans waren ja mit dem abrupten Ende der Serie damals nicht zufrieden und wollten mehr wissen; in diesem Zuge soll Anno dann angeblich "End of Evangelion" produziert haben und ... ja ... schau's Dir einfach an 
Danach möchte ich Dir unbedingt noch die "Rebuild"-Filme an's Herz legen, denn die gehen an den Stoff noch mal ganz anders ran (zumindest der dritte und vierte
) und schaffen IMO ein noch besseres Bild dieses Universums.