Nicht jeder Isekai-Anime gehört auch dem Fantasy-Genre an. Nicht jeder Fantasy-Anime gehört zum Isekai-Genre.
Das sind zwei komplett unterschiedliche Bereiche, die jedoch gerne mal zusammen in einem Anime vermischt werden, weil sie dieselben Zuschauer abholen - bzw. dadurch besser abholen. Es ist so ähnlich wie mit Marvel-Filmen. Wenn jemand Iron Man und Hult mag, wird er einen Film in dem Beide Hauptcharaktere vorkommen besonders mögen - selbst wenn der Plot nicht gerade überragend ist.
Aber zu deiner eigentlichen Frage @KuroMandrake : Nein, ich habe noch nicht erlebt, dass jemand diese Genres durcheinander bringt. Andererseits gehöre ich wahrscheinlich auch nicht zur Zielgruppe der Isekai-Produktionen und unterhalte mich somit auch eher wenig darüber.